Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CACNG1Q06432 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CACNG1Q06432 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms