Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC9Q06265 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms