Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP7AQ04656 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms