Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CREMQ03060 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CREMQ03060 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CREMQ03060 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREMQ03060 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREMQ03060 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREMQ03060 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREMQ03060 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREMQ03060 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREMQ03060 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREMQ03060 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREMQ03060 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CREMQ03060 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREMQ03060 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CREMQ03060 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREMQ03060 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREMQ03060 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREMQ03060 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREMQ03060 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREMQ03060 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREMQ03060 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREMQ03060 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CREMQ03060 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms