Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GCNT1Q02742 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCNT1Q02742 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms