Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH6A1Q02252 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms