Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN8P56748 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms