Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ATP5EP56381 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms