Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RAB9AP51151 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RAB9AP51151 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RAB9AP51151 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RAB9AP51151 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RAB9AP51151 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RAB9AP51151 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RAB9AP51151 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RAB9AP51151 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RAB9AP51151 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB9AP51151 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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