Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERFP50548 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERFP50548 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERFP50548 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERFP50548 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERFP50548 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERFP50548 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERFP50548 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERFP50548 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms