Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSK3BP49841 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms