Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACADSBP45954 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms