Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MLH1P40692 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MLH1P40692 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MLH1P40692 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MLH1P40692 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MLH1P40692 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MLH1P40692 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MLH1P40692 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MLH1P40692 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MLH1P40692 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms