Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNA7P36544 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNA7P36544 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms