Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOX11P35716 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOX11P35716 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOX11P35716 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOX11P35716 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOX11P35716 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOX11P35716 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOX11P35716 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOX11P35716 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOX11P35716 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOX11P35716 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOX11P35716 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOX11P35716 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms