Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GPC1P35052 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GPC1P35052 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GPC1P35052 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GPC1P35052 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPC1P35052 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms