Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RXRBP28702 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RXRBP28702 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RXRBP28702 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RXRBP28702 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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