Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLD1P28340 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLD1P28340 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLD1P28340 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLD1P28340 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLD1P28340 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLD1P28340 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLD1P28340 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLD1P28340 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLD1P28340 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
POLD1P28340 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POLD1P28340 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POLD1P28340 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POLD1P28340 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms