Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPRDP23468 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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