Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
IFITM1P13164 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms