Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKHD1P08F94 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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