Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F13BP05160 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
F13BP05160 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F13BP05160 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms