Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSF2P04141 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSF2P04141 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSF2P04141 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms