Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LRATO95237 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LRATO95237 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LRATO95237 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRATO95237 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRATO95237 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRATO95237 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRATO95237 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LRATO95237 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRATO95237 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRATO95237 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRATO95237 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRATO95237 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LRATO95237 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRATO95237 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRATO95237 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRATO95237 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms