Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SCN2BO60939 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms