Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BCKDKO14874 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms