Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRTO14522 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRTO14522 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
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