Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIEO00221 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFKBIEO00221 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFKBIEO00221 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms