Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPIPB9F8W1W9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms