Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms