Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC160A6NGH7 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms