Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
GOLGA6L9A6NEM1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GOLGA6L9A6NEM1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms