Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM221AA4D161 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms