Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PIPSLA2A3N6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms