Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG6Q9Y2V7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG6Q9Y2V7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms