Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms