Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
TRAPPC8Q9Y2L5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms