Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCE1Q9Y256 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms