Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAK1Q9UPV9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAK1Q9UPV9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms