Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
BRPF3Q9ULD4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
BRPF3Q9ULD4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms