Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RARRES3Q9UL19 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RARRES3Q9UL19 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms