Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF639Q9UID6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms