Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPS7AQ9UBW8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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