Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms