Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EHD3Q9NZN3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms