Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPMQ9NSP4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms