Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IL1RAPQ9NPH3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms