Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCSER1Q9C0I3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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