Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GATA5Q9BWX5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms