Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC106Q9BWC9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms